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平台成员
组织形态
影像技术
药物筛选
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动物实验中心
动物手术及活体成像
负责人:
齐进 >
创新技术平台
——
平台成员
平台成员
:
钱念东 周琦 邵志良 周寒冰 陆宇菲 倪秋怡 梁韵宁 唐云 李敬月 周欣怡
创新技术平台
——组织形态学研究
上海市重点实验室
——组织形态学研究平台
2
上海市重点实验室
——组
织细
胞图像采集与分析研究平台
1
上海市重点实验室
——组
织细
胞图像采集与分析研究平台
2
TissueFAXS全景正置扫描系统
ZEISS Image M1正置显微镜
ZEISS LSM800 激光共聚焦显微镜
Reichert Jung Heidelberg锯割切片机
EXAKT E 300 CP切片机
硬组织切片技术及切片机的沿革
新技术发展低温塑料切片
EXAKT E 310 切片机
EXAKT 400 CP 磨片机
Reichert Jung Pulycuts锯割切片机
Leica sp1600切片机
·
1959年,使用Reichert Jung Heidelberg锯割切片机
·
1991年,使用Reichert Jung Pulycuts锯割切片机
·
2003年,使用Leica sp1600切片机
·
2006年,使用EXAKT E300 CP切片机,EXAKT 400CP磨片机
·
2022年,使用EXAKT 310切片机,EXAKT 400CP磨片机
技术参数:
切割工具及技术:钻石带锯、点接触切割
切割速度:10000mm/sec
切割样品最小厚度:30um
样品尺寸范围:100mm×90mm×60mm
恒温控制:循环冷却水
打磨力度:电子量度系统控制打磨力度,最小力度1N
打磨后样品厚度:5-20um
软硬组织塑料薄切片技术,
从80年代仅局限于制作松质骨、不大于2cm×2cm的骨组织标本的塑料切片技术,沿革至今,目前可以制作植入有任何大小的各种生物材料,切片高度平行、且具最佳表面质量(5-20um)。
目前该技术领先于国内,是上海市伤骨科研究所的标志性技术,并广泛应用于骨科、口腔、肿瘤、心血管及整形外科等研究领域。
石蜡切片技术,
不仅熟练制备5 m完整无损软组织的石蜡切片,且更能体现脱钙骨组织的石蜡切片的精良技术。从常规染色、特殊染色、到免疫组化或免疫荧光(三染及四染)无不显示出技术的优势。
基于多尺寸病理切片的全景获取技术,TissueFAXS系统可以支撑大数据高通量影像学数据分析,为珍贵大样本数字化拷贝建库以及多学科交叉研究获取更高丰度的数据提供研究条件。自动化组织全景扫描及分析;多聚焦保证采集图像清晰、完整;动态聚焦/ 景深扩展/ Z-stack成像/2.5x-63x全景成像。
组织形态学技术发展的三十多年中,随着切片技术的不断精益求精,各种染色切片结果在光学、荧光及共聚焦显微镜下清晰显示组织无皱缩、折叠,结构完整、无碎裂,支架材料种植体保持在原位与宿主骨密切结合,形成牢固的界面。
激光共聚焦扫描显微成像技术(Laser Scanning Confocal Microscopy),是以激光作为光源,逐点激发样品内荧光,采用精密针孔滤波技术,有效抑制了非聚焦平面的杂散光,具有层析成像能力和很高的成像信噪比,广泛应用于生物医学等研究领域。
现代显微技术的模块化图像处理和分析系统,可通过整合特定功能的额外模块来扩展系统的图像获取、显微镜控制、图像处理和注解、图像分析、存档和配置等基本功能。通过互动测量、自动测量、高级自动测量和TIC测量等获取图像的数据信息。
Leica CM3050恒冷冰冻切片机
应用于特殊需求染色的快速组织切片。在恒定、低温情况下,以OCT为固定剂作快速切片,行免疫组化、免疫荧光、特殊酶染色等染色。
进口包埋盒打号机
可打印多种包埋盒,包括带盖包埋盒和2种不同角度打印斜面的包埋盒。打印条形码的特别优势在于能追踪整个组织学流程的进展,尤其是通过快速精确的病例识别实现可靠的信息存。
KOS微波多功能组织处理仪
微波处理骨组织快速脱钙,比传统脱钙方式的脱钙速度提高4倍。相对于形态学和染色表达,不会有任何影响。并且成片非常适用于蛋白水平组织化学染色方面的检测。
Leica ASP200自动脱水机
能容纳200个包埋盒的全封闭脱水机。用于对石蜡浸透处理和病理组织学的研究。每个脱水步骤都能设置真空、加压或两者交替进行的脱水模式,以促进试剂渗透,加速试剂置换。
EG1160石蜡包埋机
是创新发展的石蜡包埋技术和智能化高水准工艺的完美结合。时间参数全部由程序全自动控制,记忆功能配有备用电池,使病理组织学实验室的工作更为灵活。
进口玻片打号机
具有低维护、上载后即可实现无人操作、使用便捷、有序输出、多元化打印的优点。
LEICA2135切片机
独一无二、人性化且坚固耐用的拥有同类切片机从未有过的众多功能。主要用于手动的常规石蜡切片。
Imaris技术
始于1993年的尖端3D/4D/多维图像渲染及交互分析技术,具备展示、分离、分析及演绎等所有3D/4D显微图像渲染所必须的功能, 具有快速、精准及易于使用的特点,可直接读取30多种格式文件,几乎涵盖了所有显微镜厂家的图像格式。
• 轻松处理50 GB 甚至更大的3D/4D文件
• 提供Slice, Section, Gallery 等观察模式,并提供MIP 投影和混合投影模式
• 在Supass 观察方式下,各种交互工具结合展示 (Volume rendering, iso-surface rendering,clippingplanes,spots,slices)
• 通过多种分离工具,自动识别并分离数以千计的物体通过多个CPU、GPU及多分辨率渲染模式提高 Imaris 的分析能力,提高渲染速度
技术参数
• 100W 汞灯,具有高速、电动可装载6个即插即用荧光滤色镜模块的转盘,用于快速的多通道荧 光成像,避免不必要的荧光漂白;
• 荧光光路为复消色差;
• 物镜10×、20×、40×、油镜63×,自动马达载物台;
• 附带图像分析软件,具有报告自动测量、标尺、多维成像及拼接等图像后期处理功能。
技术参数
• 物镜10×、20×、40×、40×/w、63×/oil
• 可用于细胞、组织的单/多色荧光拍摄、Z轴三维构建、大视野拼图、荧光强度测量,另配有活细胞观测拍摄以及Airyscan拍摄功能
LEICA染色机
相对于人工染色可以在较短时间内完成高质量的染色,有效隔离工作人员与有毒物质的接触,为后期的显微镜观察提供高质量的染色标本,进而使得标本诊断结果更加准确。
利用带锯,以点接触的方式对不脱钙骨组织、生物材料植入物、金属材料等样品进行切割,突破了以往切片系统对标本大小的限制,切割工具更稳定,切割速度更快;通过打磨系统、粘合系统可使切割后标本达到5-20um,更方便了标本的分析。
Leica 低温塑料切片机
·
新技术发展低温塑料切片
·
可脱塑或不脱塑
·
常规染色、特殊染色、免疫组化或荧光
创新技术平台
——影像研究技术
(美国Faxitron公司)
( 美国AMETEK公司 )
( 比利时Bruker公司 )
样本中元素波峰图
样品及观察范围图
标本中元素含量图
MX-20型X光机样
本放射系统
EAGLE III 型X线聚焦
荧光能谱仪
skyscan1172 型Micro-CT
(微量X射线断层扫描)
可用于活体小动物和 动、植物标本的拍摄
可用于金属、玻璃、陶瓷、油漆等材料的分析和动物组织中的无机物示踪
· 动物病理标本,取材后的骨组织,牙齿组织扫描分析 · 动物血管灌注后的取材标本扫描分析
创新技术平台
——药物筛选
ACQUITY UPLC系统
现拥有-质联用仪、高效制备液相色谱、中压纯化制备色谱、分子互作仪等先进仪器设备
Octet分子互作仪应用方向
·
线性速度、流速、耐压范围,工作效率更高
·
高流速和高通量获得理想分离度和灵敏度
·
节省每个样品分析时间和支出
· 细胞/细菌/病毒 - 蛋白
·
抗原-抗体
· 受体-配体
· 核酸-核酸/蛋白
· 蛋白-脂类/糖类/肽类
· 蛋白-小分子化合物
· 多分子相互作用
·
双波长检测器,可支持单一波长收集另一波长监测,也可采用双波长收集
·
支持液体、固体上样
·
直观的操作
·
每份样品可获得更多信息
·
提高效率
·
是否有结合
·
Kon,Koff,KD
·
协同关系
·
竞争关系
·
细胞毒性
·
细胞信号传导
·
细胞表面受体结合
·
快速浓度检测
·
ELISA 方法转换
ACQUITY QDa质朴检测器
动力学
分子间相互关系
cBLI分子互作
定量检测
CHEETAH MP 中压快速纯化制备色谱
创新技术平台
——测序研究分析
Bioruptor Pico 非接触式超声波破碎仪
图为单细胞测序流程示意图及平台结果展示
10x Genomics Chromium 系统
Agilent 4200 TapeStation
Illumina DRAGEN Server v3
·
专为二代测序DNA 样本与染色质免疫共沉淀实验
样本前处理量身订做
·
一次性可上样品量12 支样本
·
高功率,核酸样品破碎大小:1kb~ 100bp
·
不需使用特殊材质 (如玻璃) 的耗材, 节省实验成本
·
样品在密闭容器下进行破碎动作,不产生感染性飞雾,不需额外插入超声波探头
·
技术核心是油滴包裹的凝胶珠(Gel Bead-In-Emulsions, GEM)
·
利用微流控芯片对细胞/细胞核/DNA片段进行精确区分,使每个GEM反应体系中仅有一个细胞/细胞核/DNA片段
·
该系统有75万种barcoded beads,每个bead上有40-80万探针
·
能召回前一次分离条件,并把它作为默认的实验条件
·
能召回当前电泳条件和电泳程序,如果系统因电泳仪故障而中断,能自动重新启动电泳
·
能在90-120之间的任意角度编程,可分离100 bp -10 Mb范围内的DNA分子
·
可选择特定DNA分离范围的最佳电压梯度、转换时间及角度
·
可编程3个连续执行的电泳模块
·
三种主要操作模式:浓缩仪、离心机和干燥器
·
可快速、温和地真空浓缩DNA、RNA、核苷酸、蛋白质和其他液体或湿样。
·
可在对应样品溶剂(水、酒精或高蒸气压)的三种应用模式之间进行选择
·
四种加热等级可供选择(环境温度、30 °C、 45 °C、 60 °C)。
·
轻松切换 DNA 和 RNA ScreenTape 检测以提供超大灵活性
·
仅需 1–2 µL DNA 或 RNA 样品,即使高灵敏度分析也不例外
·
依赖于 RNA 完整值(RNA 完整值当量,RINe)与基因组 DNA 完整值(DNA 完整值,DIN)
·
由于 ScreenTape 胶条对每种样品的分析均在独立泳道内进行,且每个样品配有专用枪头,可避免交叉污染。
·
DRAGEN 搭载48核CPU处理器以及GPU,256G内存 server V3服务器
·
DRAGEN平台可以在25分钟之内以30倍的覆盖度在本地处理整个人类基因组的NGS数据
·
DRAGEN平台可分析全基因组、全外显子组、靶向panel、生殖系和体细胞数据集以及RNA测序实验的测序数据。
·
DRAGEN ORA(Original Read Archive)压缩技术针对FASTQ文件的高压缩比、快速压缩和解压缩,同时保持数据完整性进行了优化
。
Concentrator plus - 浓缩仪
CHEF-DR III Chiller System
创新技术平台
——动物实验中心
动物实验指在实验室内,为了获得有关生物学、医学等方面的新知识或解决具体问题而使用动物进行的科学研究。
普通级实验兔子房:
不锈钢笼架,可饲养实验用兔子,干湿分离
,不易感染,独立饲养等优点。
大小鼠留观室:
对于术后需要进一步观察或者其他需要临时留置的大小鼠所安排的场地,拥有拿取方便,易于观察,操作便捷等优点
。
SPF级小鼠房:
套IVC设备,独立送风系统,每个笼具均相对独立,不易感染,相互隔离,更好的避免了环境与人员对于小鼠各种干扰
。
实验人员休息区:
提供实验人员休息、就餐、工作的区域
。
创新技术平台
——动物手术室
动物手术室配有小动物吸入麻醉机、可升降手术台、多功能无影灯、微量注射泵、快速灭菌器、常规手术器械
应用领域:
可肿瘤、感染性疾病、基因和细胞治疗、免疫治疗、神经疾病、生殖科学、心血管疾病、内分泌疾病、药物研发、脂肪代谢研究等。
特点:
可见光及X光多模式成像;能够成像小鼠、大鼠等多种模式动物;高分辨率、低辐射X光成像;高灵敏度生物发光成像;基于多光谱分离的高灵敏度荧光成像;成像范围覆盖整个可见光及近红外波段,能够实现X光成像与生物发光及荧光成像模式的联合使用。
小动物吸入麻醉机
微量注射泵
Lumina XR III 活体成像系统
荧光成像
生物发光成像
快速灭菌器
应用于脑缺血&心肌缺血模型制作、骨质疏松模型制作、尾静脉注射、腹主动脉采血、心脏采血、心室注射、组织/器官摘除等动物手术。
应用于化学反应注射实验、长时间动物药物注射实验及其它实验室微量注射实验等,该注射泵具有抽吸与注射功能。
功能:生物发光成像、荧光成像、 切伦科夫成像、X光成像
快速灭菌器利用高温玻璃珠,对手术钳、剪刀、镊子、解剖刀等小型手术器械进行快速的灭菌。其最高温度可达300℃,可在5S以内有效地对器械进行消毒灭菌。
地址:上海市瑞金二路197号
电话:
021-64313534
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